根据1749年《七修通谱》与1886年《汉川池口尹氏四修宗谱》的记载，我们可知1564年的《五修通谱》刊载了如下的族谱文献：
《宋宁宗皇帝赐尹氏族谱序》（原本存嵊县）
《安福诚门尹氏族谱序》（原本存安福诚门，尹躬，宋宣和己亥）
《姚江尹氏族谱序》（原本存嵊县，尹仲亨，宋绍定五年）
《东莞尹氏族谱序》（原本存东莞，尹耕，宋咸淳庚午）
《安福诚门尹氏族谱序》（原本存安福诚门，尹林宗，宋淳祐辛丑）
《订谱议——送宗兄叔弼还永新》（尹榖）
《安福诚门尹氏族谱序》（原本存安福诚门，欧阳玄，元至正戊子）
《安福诚门尹氏族谱序》（原本存安福诚门，尹存斌，元至正戊子）
《安福诚门尹氏族谱序》（原本存安福诚门，尹应丑）
《吉水新市尹氏族谱序》（原本存吉水新市，欧阳玄，元至正壬午）
《泰和灌塘尹氏族谱序》（原本存泰和灌塘，萧尚，洪武辛亥）
《泰和灌塘尹氏族谱序》（原本存泰和灌塘，独孤乐善，永乐己亥）
《泰和山田尹氏族谱序》（原本存泰和山田，尹务厚，永乐辛丑）
《泰和辛塘尹氏族谱序》（原本存泰和辛塘，陈循，永乐辛丑）
《泰和逢原尹氏族谱序》（原本存泰和逢原，钟启晦，永乐癸巳）
《泰和逢原尹氏族谱序》（原本存泰和逢原，尹昌隆）
《泰和灌塘尹氏族谱序》（原本存泰和灌塘，余学夔，宣德庚戌）
《东莞尹氏族谱序》（原本存广东东莞，陈琏，宣德己酉）
《泰和灌塘尹氏族谱序》（原本存泰和灌塘，曾鹤龄，宣德辛亥）
《吉水新市尹氏族谱序》（原本存吉水新市，杨士奇，正统己未）
《永新牛田尹氏族谱序》（原本存永新牛田，刘髦）
《永新牛田尹氏族谱序》（原本存永新牛田，萧鎡，正统壬戌）
《永新牛田尹氏族谱序》（原本存永新牛田，李祯，正统壬戌）
《泰和逢原尹氏族谱序》（原本存泰和逢原，萧鎡）
《泰和山田尹氏族谱序》（原本存泰和山田，王直，天顺辛巳）
《泰和逢原尹氏族谱序》（原本存泰和逢原，邱濬，成化己丑）
《泰和逢原尹氏族谱序》（原本存泰和逢原，尹直，成化丁未）
《安福诚门尹氏族谱序》（原本存安福诚门，林文，成化甲午）
《泰和逢原尹氏族谱序》（原本存泰和逢原，刘定之，成化丁亥）
《安福集凤尹氏族谱序》（原本存安福集凤，彭勉敬，嘉靖甲午）
《永宁古田尹氏族谱序》（原本存永宁古田，邹守益，嘉靖己未）
《祠谱述》（泰和灌塘尹材，隆庆辛未）
《汉川池口尹氏支谱述》（尹心周，隆庆庚午）
《汉川池口尹氏支谱考》（尹适）
《汉川池口尹氏族谱序》（尹应元，万历癸酉）
《永宁古田尹氏族谱序》（尹祖尧，隆庆壬申）
《尹氏源流考节录》（尹凤岐，正统己巳）
《劝建总祠修通谱疏》（尹一仁）
《尹氏通谱序》（邹善）
《尹氏通谱序》（傅颐）
《尹氏通谱序》（何迁）
《尹氏通谱序》（朱衡）
《尹氏通谱序》（尹一仁）
《尹氏通谱序》（尹学孔）
《尹氏通谱志》（尹学孔）
《通谱跋》（尹焘）
《通谱跋》（尹新）
《跋尹氏通谱》（刘阳）
《宋节度使尹氏祖祠记》（刘阳）
《尹氏孚萃堂记》（刘教）
1564年《五修通谱》收录了各地支谱的旧序文，于是在序文后注明“原本存ХХ”，分别有吉水新市、泰和山田、泰和逢原、泰和辛塘、广东东莞、安福诚门、永新牛田、安福集凤、永宁古田、泰和灌塘、浙江嵊县。第一次刊入《宋宁宗皇帝赐尹氏族谱序》与尹凤岐的《尹氏源流考节录》，载入尹一仁的《劝建总祠修通谱疏》，六篇《尹氏通谱序》，三篇跋，一篇志，两篇记。除了北派之外，应该还刊入了南派永新竹山尹氏的旧序文。汉川池口尹氏参与《五修通谱》，是为首修谱，刊入三篇序文，永宁古田、泰和灌塘均刊入一篇序文。
本次修谱，第一次刊入《恩纶志》、《登庸志》、《隐逸志》、《历朝翰墨》、《节烈志》，有《凡例》若干则，《祠典》八条，《祠训》八条，《祠规》八条。其中，《恩纶志》由各派受自朝廷的诰令汇编而成，《登庸志》、《隐逸志》与《节烈志》均根据各支材料撰成。《历朝翰墨》有如下内容：
《尹翁归循吏传》
《尹思贞循吏传》
《节度公副潘美平刘鋹露布》
《尹师鲁河南集序》（宋·范仲淹）
《尹焞名儒传》
《尹和靖言行录序》（宋·朱熹）
《书和靖先生遗墨后》（宋·朱熹）
《尹商老易解序》（宋·胡铨）
《尹进可文集序》（宋·文天祥）
跋《尹商老易解、尹进可文集》（彭时）
《送海宁尹知州序》（元至正辛巳，刘基）
《前左春坊中允讷庵尹公像赞并序》（嘉靖己亥，罗洪先）
《赠灌溪松冈诗序》（欧阳德）
《别尹道舆令太和序》（嘉靖乙卯，罗洪先）
《尹公亭记》（宋·曾巩）
《和靖先生祠堂记》（宋嘉定甲戌，黄瀚）
《高门读书处记》（李时勉）
《孝友堂记》（陈循）
《尹氏重建读书楼记》（刘俨）
《牛田尹氏宗祠承庆堂记》（正统己未，刘定之）
《赠勅旌义民牛渚渔隐记》（正统己巳，刘定之）
《南株尹氏祠堂记》（刘定之）
《尚义门记》（天顺戊寅，尹直）
《灌溪邦贶寿藏记》（罗钦顺）
《和靖尹先生祠记》（赵渊）
